Rencontres LEGO 2025
Machine learning pour la génomique
27 et 28 novembre
Nantes, journées du GDR BIMMM

GT LEGO

LEGO est un groupe de travail rattaché au GDR BIMMM du CNRS et dédié au machine learning pour la génomique.

Comme de nombreux domaines scientifiques, la génomique bénéficie de la montée en puissance qu’a connue le machine learning au cours de la dernière décennie. La communauté française de recherche en machine learning pour la génomique est active mais dispersée sur le territoire au sein d’équipes traditionnellement expertes dans d’autres domaines méthodologiques pour la génomique tels quel la statistique, l’algorithmique ou la bioinformatique.

L’objet du groupe de travail LEGO est de faciliter les échanges au sein de cette communauté, de favoriser les collaborations, et de permettre le suivi des progrès effectués par les équipes participantes.

Ces cinquièmes rencontres s'inscrivent dans le cadre des journées du GDR BIMMM, qui ont lieu tous les deux ans.

Site web: https://gt-lego.cnrs.fr

Keynotes

Vincent Mallet

Vincent Mallet, chercheur au CBIO, Mines ParisTech

Titre: Rationalizing machine learning on biomolecules structures, applications to RNA therapeutics and PPI predictions
Anna Zhukova

Anna Zhukova, group leader à l'IBENS/Institut Pasteur

Titre: Estimating factors of epidemic spread with deep learning-enabled phylodynamics

Appel à contributions

Nous acceptons les résumés de 300 mots maximum, en français ou en anglais, décrivant des recherches en cours ou publiées récemment sur des sujets de machine learning pour la génomique.

Les membres de l’animation du GT sélectionneront un sous-ensemble des résumés soumis pour des présentations orales, et d’autres pour une présentation sous forme de posters. Les présentations auront lieu en anglais.

Les résumés sont à envoyer via cette page à partir du 1er septembre 2025 et avant le 8 octobre 2025. Les décisions seront rendues le 15 octobre.

Organisation

La rencontre LEGO se tiendra sur deux jours:

  • Le jeudi 27 sera dédié aux keynotes, présentations orales et posters acceptés parmis les abstracts soumis. 
  • Le vendredi 28 au matin sera réservé à un workshop sur les modèles de fondation pour l'ADN et la régulation des génomes. L'après midi sera de nouveau dédié aux présentations.

Les rencontres se tiendront au Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes (LS2N), sur le campus de la Faculté des Sciences et Techniques (2 chemin de la Houssinière, 44300 Nantes), bâtiment 34 (https://maps.app.goo.gl/9S3jPtr3G9nM2RyU7).

Un déjeuner sera proposé aux personnes inscrites.

L'événement est gratuit, mais l'inscription obligatoire avant le 24 octobre 2025 pour raisons logistiques. Cette inscription se fait sur le site dédié des journées du GDR BIMMM.

Code de conduite

(librement adapté de NeurIPS et ICML)

Les évènements du GT LEGO visent à rassembler la communauté française de l’apprentissage automatique pour la génomique afin de favoriser un échange d’idées et un débat scientifique respectueux.

Notre objectif est que toute personne intéressée par ces évènements puisse y participer sereinement, et notamment sans subir de harcèlement ou de discrimination raciste, sexiste, homophobe, transphobe ou validiste.

L’équipe d’animation du GT se tient à la disposition des témoins ou victimes de tels incidents ou de toute autre comportement non-professionnel, et agira au mieux pour protéger leur confidentialité.

Sponsors

La rencontre est soutenue par le GDR BIMMM

 

Logo du GDR BIMMM
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